Por produzir contrações uterinas, o uso do remédio pode ocasionar o aborto. O citotec é composto da substância denominada misoprostol , uma versão sintética da prostaglandina E1 (PGE1). Além de abortivo, o citotec pode causar náuseas, vômitos, diarréia, fortes dores abdominais, febre e tremores.
Não existem estudos definitivos que comprovem efeitos nocivos ao feto se houver falha do medicamento, mas existem efeitos descritos como redução de membros, paralisia de nervos cranianos e anomalias do Sistema Nervoso Central, conforme o ginecologista Paulo Afonso Beltrame.
Após o aborto, o médico explica que nem sempre é preciso realizar a curetagem, pois pode ocorrer a expulsão completa da placenta e feto. Ele ainda conta que tem conhecimento de alguns profissionais que utilizam a medicação para preparar o colo do útero na indução do parto. Beltrame revela que uma pequena porcentagem de suas pacientes até busca a prática do aborto no consultório, mas que a maioria desiste após uma conversa.